En bref. On peut changer de logiciel à tout moment. Le bon moment est un début de mois (ou de trimestre si vous déclarez la TVA chaque trimestre). L'essentiel : exporter avant de résilier, garder 10 ans vos documents comptables, et, si votre ancien outil était aussi votre Plateforme Agréée, suivre la procédure officielle de changement.

Les raisons qui reviennent le plus

En lisant les avis publiés en ligne sur les logiciels de gestion les plus utilisés par les TPE, les mêmes motifs de départ reviennent :

  • un support qu'on n'arrive plus à joindre au moment critique (échéance de TVA, contrôle, clôture) ;
  • des hausses de prix fortes d'une année sur l'autre, ou des options devenues payantes ;
  • des bugs qui font perdre du temps : rapprochement bancaire, synchronisation, lenteurs ;
  • un outil qui ne suit plus : premier salarié, TVA, plusieurs utilisateurs ;
  • un logiciel imposé par le cabinet, qui ne convient pas au dirigeant.

Étape 1 : choisir la date de bascule

Visez le 1er jour d'un mois. Si vous déclarez la TVA chaque trimestre, le début d'un trimestre est encore plus simple. Évitez les semaines d'échéance (TVA, DSN, clôture). Le début d'exercice reste l'idéal, mais il n'est pas obligatoire : votre expert-comptable peut reprendre les écritures des deux outils.

Étape 2 : tout exporter avant de résilier

À récupérerPourquoi
Le FEC (fichier des écritures comptables)Votre cabinet en a besoin pour la clôture ; c'est aussi le fichier demandé en cas de contrôle.
Toutes vos factures émises et reçues, si possible dans leur format d'origine (Factur-X, UBL…) et en PDFElles se conservent 10 ans (article L123-22 du code de commerce).
Les fichiers clients, fournisseurs et articles (CSV ou Excel)Pour ne rien ressaisir, SIREN compris.
Les devis en cours et les factures non encore payéesPour suivre les relances sans trou.
Les justificatifs (tickets, notes de frais)Ils accompagnent les écritures.
Si vous avez des salariés : bulletins, cumuls annuels, soldes de congésIndispensables pour reprendre la paie en cours d'année.

Étape 3 : régler la facture électronique

Depuis le 1er septembre 2026, vous devez pouvoir recevoir vos factures par une Plateforme Agréée. Si votre ancien logiciel était aussi votre plateforme, il faut changer de plateforme, selon la procédure officielle de juillet 2026 : c'est la nouvelle plateforme qui met à jour l'annuaire. Comptez environ un mois.

Étape 4 : faire tourner les deux outils quelques jours

Gardez l'accès à l'ancien outil jusqu'à la fin de la période payée, pour vérifier que les soldes d'ouverture et les factures en attente sont bien repris. N'émettez pas de factures dans les deux outils : une seule numérotation doit continuer, sans trou ni doublon.

Étape 5 : résilier proprement

  • Relisez les conditions : préavis, date d'échéance, renouvellement automatique.
  • Demandez la résiliation par écrit et gardez la preuve de votre demande et de la confirmation.
  • Surveillez vos relevés les deux mois suivants. Si un prélèvement continue malgré la résiliation confirmée, révoquez le mandat de prélèvement et prévenez votre banque.

Étape 6 : prévenir les bonnes personnes

Votre expert-comptable (pour qu'il récupère le FEC et ouvre son accès au nouvel outil), vos clients si vos coordonnées de paiement changent, et vos fournisseurs si votre adresse de facturation électronique change.

Les 5 erreurs qui coûtent cher

  • Résilier avant d'avoir exporté : certains outils ferment l'accès dès la fin de l'abonnement.
  • Basculer en pleine semaine de TVA ou de DSN.
  • Recommencer la numérotation des factures à 1.
  • Oublier les cumuls de paie : les bulletins de fin d'année seront faux.
  • Choisir le nouvel outil sans avoir parlé à quelqu'un : c'est souvent le support qui a fait partir de l'ancien.

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Article à jour au 4 novembre 2026.

Questions fréquentes

Peut-on changer de logiciel de comptabilité en cours d'année ?

Oui. Le plus simple est de basculer un début de mois, ou de trimestre si vous déclarez la TVA chaque trimestre, après avoir exporté le FEC, les factures et les fichiers clients et fournisseurs. Votre expert-comptable reprend les écritures des deux outils à la clôture.

Que faut-il exporter avant de quitter son logiciel ?

Le FEC, toutes les factures émises et reçues (format d'origine et PDF), les fichiers clients, fournisseurs et articles, les devis en cours, les justificatifs et, si vous avez des salariés, les bulletins, cumuls annuels et soldes de congés.

Combien de temps faut-il conserver ses factures ?

Les documents comptables et les pièces justificatives se conservent 10 ans (article L123-22 du code de commerce).

Mon logiciel était aussi ma Plateforme Agréée : que faire ?

Il faut changer de plateforme selon la procédure fixée par l'arrêté du 27 juillet 2026 : vous signez un accord avec la nouvelle plateforme, qui met à jour l'annuaire central. Comptez environ un mois.

Peut-on garder la même numérotation de factures ?

Oui, et il le faut : la numérotation doit rester continue, sans trou ni doublon. Reprenez dans le nouvel outil à partir du numéro qui suit la dernière facture émise dans l'ancien.

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